🔬 Un consorcio del Reino Unido creó un biobanco abierto de 256 organoides tumorales obtenidos de pacientes y trazó dependencias génicas con CRISPR–Cas9 en 162 de ellos. El recurso abarca cinco tipos de cáncer y busca ayudar a vincular rasgos tumorales con posibles vulnerabilidades.
Los organoides procedían de cáncer colorrectal, esofágico, ovárico, pancreático y gástrico. El equipo los obtuvo de 907 muestras de 878 donantes y exigió que crecieran hasta más de 25 millones de células, pudieran congelarse y volver a cultivarse, y conservaran variantes del tumor original.
Cada modelo pasó por secuenciación del genoma completo y del transcriptoma. En 171 casos, los autores compararon el organoide con el tumor del mismo paciente y observaron alta concordancia en varias señales genómicas. Los cribados CRISPR identificaron 654 genes esenciales compartidos con líneas celulares y 97 propios de los organoides.
El mapa también mostró que la dependencia de EGFR, KRAS y otras piezas de esta vía varía según la variante de KRAS en organoides colorrectales. En muestras emparejadas antes y después de quimioterapia, los perfiles detectaron cambios en dependencias y en la respuesta a varios inhibidores.
✅ El biobanco, con datos clínicos y genómicos, ofrece modelos renovables para estudiar por qué tumores del mismo tipo pueden responder de forma distinta. Aun así, solo cubre cinco cánceres y las condiciones de cultivo pueden favorecer subtipos moleculares o alterar dependencias; los autores proponen sumar datos más profundos y cultivos con estroma e inmunidad.
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