🔬 El equipo de Delphy presenta en Nature una herramienta para reconstruir el parentesco entre virus y seguir brotes. En pruebas con datos de epidemias, obtuvo resultados comparables a herramientas bayesianas de referencia, hasta 1 000 veces más rápido. El método también estima cuánto margen de incertidumbre tienen sus resultados.
Delphy construye árboles de parentesco que registran mutaciones y fechas. Aprovecha que muchas secuencias de un brote son casi idénticas: concentra los cálculos en los cambios locales entre ellas. Su versión web funciona en el navegador, sin instalar programas, y los datos permanecen en la computadora del usuario.
El equipo comparó Delphy con otras herramientas usando datos de SARS-CoV-2, ébola, zika y H5N1. En el análisis de H5N1, Delphy produjo resultados en 42 minutos. La ejecución de BEAST X se interrumpió tras 21 días, antes de llegar a la mitad. Las ventajas fueron menores en conjuntos pequeños, como el de zika.
En otra prueba, Delphy analizó 100 000 secuencias simuladas en menos de 15 horas, usando una máquina virtual con 96 procesadores virtuales. Esa escala aún plantea dificultades: el equipo detectó un desajuste al estimar el tamaño de la población viral. Reducir ese error exigió más recursos de cálculo.
✅ Delphy podría facilitar que los equipos de salud pública analicen sus propios datos para seguir linajes y mutaciones durante un brote. Su ventaja depende de que las secuencias sean muy parecidas; las fechas de muestreo poco precisas pueden dificultar el análisis. Además, la versión actual no contempla errores al leer las secuencias.
⚕️ No es consejo médico.
