🔬 Un equipo liderado por Ben Lehner, del Wellcome Sanger Institute, creó más de 44 000 variantes del virus phi X para medir el efecto de casi cada cambio posible en su ADN. El preprint sugiere que muchos daños al virus aún escapan a la explicación y a las predicciones de la IA.
Phi X tiene un genoma circular de ADN monocatenario con 5 386 nucleótidos y codifica 11 proteínas. Los autores cambiaron, de uno en uno, cada nucleótido por sus otras tres opciones y cada aminoácido por sus 19 alternativas posibles.
Luego cultivaron miles de variantes junto con Escherichia coli durante 80 minutos, tiempo suficiente para dos o tres ciclos de infección. Las variantes que se multiplicaron se consideraron exitosas; las que llevaban cambios dañinos desaparecieron. La mitad de las mutaciones de un solo nucleótido y el 60 % de las que alteraban aminoácidos perjudicaron al virus. Unas pocas incluso mejoraron su capacidad de multiplicarse.
Los autores atribuyen cerca de la mitad de los cambios dañinos en aminoácidos a posibles fallos en interacciones con proteínas. Otro cuarto afectó aminoácidos situados en el interior de una proteína, lo que podría comprometer su estructura. Para los demás, no encontraron una explicación clara. Los sistemas de IA evaluados también tuvieron dificultades para predecir estos efectos.
✅ El trabajo apunta a que incluso un virus estudiado durante décadas conserva partes difíciles de interpretar. También subraya que las herramientas de IA biológica necesitan más datos experimentales. El estudio es un preprint, pendiente de revisión por pares, y examina un solo virus en condiciones de laboratorio.
